Après des études en musicologie à l’Université de Montréal, Mario Gauthier a co-fondé la Société de Concerts Alternatifs du Québec(1986 : aujourd’hui Codes D’accès) avant de devenir réalisateur à l’ex-chaîne Culturelle de Radio-Canada (1986-2004). Il y a enregistré près de trois cents concerts, produit une cinquantaine de disques et réalisé plus de mille émissions, dont L’espace du son pour laquelle il remportera le Prix OPUS, événement médiatique de l’année en 2000.
À partir de 2004, il déploiera ses activités dans différents domaines : improvisateur au sein du collectif d’improvisation électroacoustique Theresa Transistor (depuis 2005), archiviste (2005-2024, par intermittences), matriçage audio (depuis 2007) et professeur de musique à l’école Vincent D’Indy (2012-2018).
En 2016, grâce au soutien du CALQ et du CAC, il a réalisé la restauration complète de la bande magnétique accompagnant Tétrachromie(1963) pour sept instruments et sons électroniques de Pierre Mercure. L’œuvre, considérée jusque-là comme impossible à rejouer (bande perdue) fut créée à Montréal, par la SMCQ, plus de cinquante ans après sa création sur disque. Il est chercheur associé au laboratoire La création sonore / Cinéma / art médiatiques / arts du son (U. de MTL) depuis 2012 et chargé de cours à l’UQAM (école des médias) depuis 2019